Ian et Mathieu discutent des dernières données sur les différents variants du SARS-CoV-2 !
Dans ce 64e épisode de FrancoFOAM, on discute principalement
- des données sur les variants préoccupants (variant of concern) principalement celui britannique, brésilien et sud-africain.
- MAJ du 31-5-2021 Nouvelle nomenclature des variants de l’OMS utilisant l’alphabet grec
- la morbidité & mortalité des variants
- la vaccination et les variants
Les objectifs de l’épisode :
- Discuter des dernières données concernant les variants du SARS-CoV-2 (principalement le variant britannique, brésilien et sud-africain)
- Comprendre l’impact des variants sur l’évolution de la pandémie
Les messages clé de l’épisode :
- Les variants doivent être pris au sérieux
- Les variants sont plus transmissibles
- Les variants peuvent mettre en péril des systèmes de santé
- Le variant britannique cause plus de maladie sévère, cela semble être le cas également avec les autres variants
- La vaccination demeure la clé au contrôle de la pandémie
Ian et Mathieu ne déclarent aucun conflit d’intérêt.
La déclaration de conflit d’intérêt des membres de l’équipe du FrancoFOAM est disponible ici
Les références :
- Plante JA, Mitchell BM, Plante KS, Debbink K, Weaver SC, Menachery VD. The variant gambit: COVID-19’s next move. Cell Host Microbe. 2021 Mar 1:S1931-3128(21)00099-8. doi: 10.1016/j.chom.2021.02.020. Epub ahead of print. PMID: 33789086; PMCID: PMC7919536.
- Forni G, Mantovani A; COVID-19 Commission of Accademia Nazionale dei Lincei, Rome. COVID-19 vaccines: where we stand and challenges ahead. Cell Death Differ. 2021 Feb;28(2):626-639. doi: 10.1038/s41418-020-00720-9. Epub 2021 Jan 21. PMID: 33479399; PMCID: PMC7818063.
- Mahase E. Covid-19: Where are we on vaccines and variants? BMJ. 2021 Mar 2;372:n597. doi: 10.1136/bmj.n597. PMID: 33653708.
- Li Q, Nie J, Wu J, Zhang L, Ding R, Wang H, Zhang Y, Li T, Liu S, Zhang M, Zhao C, Liu H, Nie L, Qin H, Wang M, Lu Q, Li X, Liu J, Liang H, Shi Y, Shen Y, Xie L, Zhang L, Qu X, Xu W, Huang W, Wang Y. SARS-CoV-2 501Y.V2 variants lack higher infectivity but do have immune escape. Cell. 2021 Feb 23:S0092-8674(21)00231-2. doi: 10.1016/j.cell.2021.02.042. Epub ahead of print. PMID: 33735608; PMCID: PMC7901273.
- Annavajhala MK, Mohri H, Zucker JE, Sheng Z, Wang P, Gomez-Simmonds A, Ho DD, Uhlemann AC. A Novel SARS-CoV-2 Variant of Concern, B.1.526, Identified in New York. medRxiv [Preprint]. 2021 Feb 25:2021.02.23.21252259. doi: 10.1101/2021.02.23.21252259. PMID: 33655278; PMCID: PMC7924303.
- A DC, F C, N P, Nj B, O E, E P, Mpg K. SARS-CoV-2 escape mutants and protective immunity from natural infections or immunizations. Clin Microbiol Infect. 2021 Mar 29:S1198-743X(21)00146-4. doi: 10.1016/j.cmi.2021.03.011. Epub ahead of print. PMID: 33794345; PMCID: PMC8007194.
- Hoffmann M, Arora P, Groß R, Seidel A, Hörnich BF, Hahn AS, Krüger N, Graichen L, Hofmann-Winkler H, Kempf A, Winkler MS, Schulz S, Jäck HM, Jahrsdörfer B, Schrezenmeier H, Müller M, Kleger A, Münch J, Pöhlmann S. SARS-CoV-2 variants B.1.351 and P.1 escape from neutralizing antibodies. Cell. 2021 Mar 20:S0092-8674(21)00367-6. doi: 10.1016/j.cell.2021.03.036. Epub ahead of print. PMID: 33794143; PMCID: PMC7980144.
- Dicken SJ, Murray MJ, Thorne LG, Reuschl AK, Forrest C, Ganeshalingham M, Muir L, Kalemera MD, Palor M, McCoy LE, Jolly C, Towers GJ, Reeves MB, Grove J. Characterisation of B.1.1.7 and Pangolin coronavirus spike provides insights on the evolutionary trajectory of SARS-CoV-2. bioRxiv [Preprint]. 2021 Mar 22:2021.03.22.436468. doi: 10.1101/2021.03.22.436468. PMID: 33791702; PMCID: PMC8010729.
- Challen R, Brooks-Pollock E, Read JM, Dyson L, Tsaneva-Atanasova K, Danon L. Risk of mortality in patients infected with SARS-CoV-2 variant of concern 202012/1: matched cohort study. BMJ. 2021 Mar 9;372:n579. doi: 10.1136/bmj.n579. PMID: 33687922; PMCID: PMC7941603.
- Grint DJ, Wing K, Williamson E, McDonald HI, Bhaskaran K, Evans D, Evans SJ, Walker AJ, Hickman G, Nightingale E, Schultze A, Rentsch CT, Bates C, Cockburn J, Curtis HJ, Morton CE, Bacon S, Davy S, Wong AY, Mehrkar A, Tomlinson L, Douglas IJ, Mathur R, Blomquist P, MacKenna B, Ingelsby P, Croker R, Parry J, Hester F, Harper S, DeVito NJ, Hulme W, Tazare J, Goldacre B, Smeeth L, Eggo RM. Case fatality risk of the SARS-CoV-2 variant of concern B.1.1.7 in England, 16 November to 5 February. Euro Surveill. 2021 Mar;26(11):2100256. doi: 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.11.2100256. PMID: 33739254; PMCID: PMC7976383.
- Davies NG, Abbott S, Barnard RC, Jarvis CI, Kucharski AJ, Munday JD, Pearson CAB, Russell TW, Tully DC, Washburne AD, Wenseleers T, Gimma A, Waites W, Wong KLM, van Zandvoort K, Silverman JD; CMMID COVID-19 Working Group; COVID-19 Genomics UK (COG-UK) Consortium, Diaz-Ordaz K, Keogh R, Eggo RM, Funk S, Jit M, Atkins KE, Edmunds WJ. Estimated transmissibility and impact of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7 in England. Science. 2021 Mar 3:eabg3055. doi: 10.1126/science.abg3055. Epub ahead of print. PMID: 33658326.
- Davies NG, Jarvis CI; CMMID COVID-19 Working Group, Edmunds WJ, Jewell NP, Diaz-Ordaz K, Keogh RH. Increased mortality in community-tested cases of SARS-CoV-2 lineage B.1.1.7. Nature. 2021 Mar 15. doi: 10.1038/s41586-021-03426-1. Epub ahead of print. PMID: 33723411.
- Luo R, Delaunay-Moisan A, Timmis K, Danchin A. SARS-CoV-2 biology and variants: anticipation of viral evolution and what needs to be done. Environ Microbiol. 2021 Mar 26. doi: 10.1111/1462-2920.15487. Epub ahead of print. PMID: 33769683.
- SARS-CoV-2 variant with lineage B.1.351 clusters investigation team; Members of the SARS-CoV-2 variant with lineage B.1.351 clusters investigation team. Linked transmission chains of imported SARS-CoV-2 variant B.1.351 across mainland France, January 2021. Euro Surveill. 2021 Apr;26(13). doi: 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.13.2100333. PMID: 33797392.
- Mascola JR, Graham BS, Fauci AS. SARS-CoV-2 Viral Variants-Tackling a Moving Target. JAMA. 2021 Apr 6;325(13):1261-1262. doi: 10.1001/jama.2021.2088. PMID: 33571363. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33571363/
- Ribas Freitas AR, Beckedorff OA, de Gòes Cavalcanti LP, et al. The emergence of novel SARS-CoV-2 variant P.1 in Amazonas (Brazil) was temporally associated with a change in the age and gender profile of COVID-19 mortality. PRE-PRINT DOI: https://doi.org/10.1590/SciELOPreprints.2030
Outils et liens
- Outils disponible sur le site du CDC afin de suivre l’évolution de la situation sur les variants
- Carte interactive sur l’évolution des variants au niveau mondial
- Section regroupant l’information sur les variants
- Lettre des membres du Lancet COVID-19 Commission Taskforce on Public Health, concernant l’impact que les variants vopnt avoir sur le devenir de la pandémie
- Excellent tweetorial du Dre Zoë Hyde démystifiant les variants
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